خدمات تعیین توالی شرکت Microsynth

شما اینجاهستید

خدمات تعیین توالی شرکت Microsynth

شرکت آرکا طب روهام (ATR) برای اولین بار در ایران با در اختیار داشتن نمایندگی انحصاری شرکت Microsynth سوئیس، قادر به ارائه خدمات تعیین توالی شرکت Microsynth به روش سنگر (Sanger) می‌باشد.

شرکت Microsynth سوئیس

Microsynth

 

 

خدمات تعیین توالی شرکت Microsynth به روش سنگر (Sanger)

√ کیفیتی بالا و تضمین‌شده

شرکت Microsynth سوئیس با بیش از 25 سال تجربه در خدمات تعیین توالی سنگر پیشرو در ارائه خدمات توالی یابی در اروپا است. Microsynth با داشتن آزمایشگاه‌های تعیین توالی سنگر در سوئیس، اتریش و آلمان می‌تواند این سرویس را با سرعت بی‌نظیر و با صحت بالا مطابق با ISO17025: 2005 به گروه‌های تحقیقاتی دانشگاه‌های عالی اروپا و بخش‌های دولتی و صنعتی ارائه دهد.

√ مزایای سفارش توالی یابی سنگر از شرکت Microsynth سوئیس:

♦ توانایی خوانش بیش از 1100 باز

♦ سنتز و نگهداری پرایمرهای خاص تا یک سال

♦ تکرار واکنش‌های ناموفق به‌صورت رایگان

 ♦ مقرون‌به‌صرفه: بیش از 90 پرایمر استاندارد به‌صورت رایگان در فرم توالی یابی قرارگرفته است که مشتری با انتخاب آن‌ها هزینه‌ای پرداخت نمی‌کند (حتی پرایمرهای خاص در این فرم قرارگرفته که همگی رایگان هستند)

♦ ارائه رایگان روش‌های تعیین توالی بهینه برای الگوهای غنی از GC یا ساختارهای سنجاق سری

♦ سریع: ارائه نتایج کمتر از دو هفته به مشتری

√ راهنمای مرحله‌به‌مرحله توالی یابی سنگر Microsynth سوئیس:

1) تخلیص محصول PCR با پروتکل‌های مناسب یا تخلیص پلاسمید با کیت‌های تجاری

محصول PCR و پلاسمید و همچنین پرایمر ها، همگی باید در آب مقطر حل شوند و ترجیحاً برای بالا بردن پایداری، نمونه‌ها در بافر (10mM Tris-HCl (pH 8 یا(10mM Tris-HCl (pH 8همراه با  0.5mM EDTA حل شود. لطفاً توجه نمایید استفاده از بافر (TE (10 mM Tris-HCL, 1 mM EDTA موجب تداخل در توالی یابی شده و به‌هیچ‌عنوان از این بافر برای حل کردن نمونه و پرایمر ها استفاده نکنید.

480-1200ng (2 برای پلاسمید و 18ng/100bp برای محصول PCR (به‌طور مثال 72ng برای 400bp محصول PCR) در میکرو تیوب 1.5 میلی‌لیتری پیپت نموده (میکرو تیوب‌ها باید به‌صورت در پیچی باشند تا از باز شدن ناگهانی میکرو تیوب‌ها در حین انتقال نمونه جلوگیری شود) و حجم هر نمونه باید 20 میکرو لیتر باشد. (جدول زیر را مطالعه نمایید).

شاید این مطلب برای شما مفید باشد
سنجش میزان زنده ماندنی سلول و سمیت مواد با آزمایش MTT و XTT

3) اضافه نمودن هر پرایمر به میزان 30pmol یا انتخاب یک پرایمر استاندارد از فرم سفارش (جدول زیر را مطالعه نمایید).

4) پر نمودن فرم سفارش

5) ایمیل نمودن فرم سفارش به آدرس info@atrmed.com

6) در آخر نمونه‌ها در یک پلاستیک شفاف زیپ‌دار قرار دهید و به شرکت آرکا طب روهام ارسال کنید (آدرس محل شرکت در زیر سایت قرار دارد).

7) جواب نهایی توالی یابی به ایمیل فرد سفارش‌دهنده که در فرم سفارش نوشته‌شده است ارسال می‌گردد.

 

volume

Concentration

Template

20μl 40-100ng/ul plasmide
 20μl

  General Rule: 1.5 ng/ul per 100 bp

 30ng/ul
15ng/ul
7.5ng/ul
4ng/ul

(PCR (purified and unpurified products

PCR 1000-2000 bp
PCR 500-1000 bp
PCR 250-500 bp
PCR 100-250 bp

 20μl
(30pmol)
 

10pmol⁄ μl = 10 μM
2pmol⁄ μl

Primer

(As separate tube (enclosed
Premixed

 √ دلایل ناموفق بودن توالی یابی به روش سنگر:

مشتریان عزیز

شرکت مذکور همیشه تلاش می‌کند تا با مراحل پردازش بهینه‌شده و اثبات‌شده همراه با 25 سال تجربه خود توالی یابی سنگر را به بهترین نحو ممکن انجام دهد تا نتایجی قابل‌قبول و باکیفیت ارائه شود. بااین‌حال عواملی وجود دارد که می‌تواند بر روی نتایج تأثیرگذار باشند. تعدادی از این دلایل توسط آنالیز کروماتوگرام قابل‌شناسایی هستند و برخی دیگر نیاز به اطلاعات بیشتری دارد.

در زیر شایع‌ترین دلایل ناموفق بودن یا ضعیف بودن نتایج توالی یابی ذکرشده است:

1- کیفیت ضعیف DNA

بیشتر از مقدار DNA، کیفیت DNA شما مهم است. از یک DNA تمیز حتی با مقدار کم نتایج خوبی حاصل می‌شود. روش‌های تخلیص سازی سنتی (به‌عنوان‌مثال، لیز قلیایی و تخلیص با ستون) معمولاً نمونه‌های DNA ایی باکیفیتی را ارائه می‌دهند که این کیفیت همراه با مقادیری که توسط این شرکت سوئیسی ذکرشده (به جدول بالا توجه کنید) برای به دست آوردن نتایج توالی یابی عالی و مطلوب کافی است. بااین‌وجود توالی یابی وکتورهای “کم کپی” مشکل‌تر هستند، زیرا این نمونه‌ها ذاتاً آلودگی بیشتری را با DNA دارا هستند. در این‌جور موارد مرحله پاک‌سازی اضافی اغلب لازم است.

2- غلظت کم یا زیاد DNA

غلظت ناکافی DNA می‌تواند به‌راحتی از اندازه‌گیری نمونه‌های الیکوت شده DNA جلوگیری کند. این کمپانی سوئیسی پیشنهاد می‌دهد تا از روش فلوریمتریک (اندازه‌گیری با نور فلورسانس) استفاده شود اگرچه روش‌های فتومتریک، اندازه‌گیری طول باند و کمیت سنجی با DNA استاندارد در ژل نیز مناسب هستند. ارسال نمونه‌ها با غلظت 40/100ng  پلاسمید و 1.5ng/100bpبرای محصول PCR کافی است.

3- طراحی نامناسب پرایمر

طراحی مناسب پرایمر برای توالی یابی با یک نتیجه عالی ضروری است. ممکن است استفاده از یک پرایمر در واکنش زنجیره‌ای پلیمر از کارایی خوبی داشته باشد ولی استفاده آر همین پرایمر در توالی یابی نتیجه مطلوبی ندهد. این اتفاق به‌این‌علت است که در واکنش زنجیره‌ای به‌صورت لگاریتمیک هر محصول با استفاده از پرایمر سنتز می‌شود اما همین پرایمر در هنگام استفاده در توالی یابی تنها یک ست محصول در هر چرخه تولید می‌کند بنابراین اگر کارایی پرایمر طراحی‌شده پایین باشد، محصول لیلبل شده با فلورسنت به مقدار کمتری در هنگام توالی یابی تولید می‌شود درنتیجه توالی یابی مطلوبی نخواهیم داشت.

√  فاکتورهای مهم برای طراحی یک پرایمر ایده آل:

♦ محتوای GC متعادل

♦ اجتناب کردن از ساختارهای سنجاق سری، پالیندروم یا تشکیل پرایمر دایمر

♦ طول پرایمر در حالت ماکسیمم 20 باز باشد

♦ در انتهای ‘3 تا 7 بازداری جایگاه دوم اتصال نباشد

♦ دارای دمای ذوب 60-50 درجه سانتی‌گراد

♦ در انتهای ‘3 دارای باز G یا C باشد

برای کسب اطلاعات بیشتر و مطالعه در مورد دلایل عدم موفقیت توالی یابی می‌توانید مقالهٔ زیر را که مربوط به شرکت Microsynth سوئیس مطالعه فرمایید.

TroubleshootingGuide_Sanger

سفارش آنلاین

و برای سفارش خدمات تعیین توالی شرکت Microsynth می‌توانید از طریق راه‌های ارتباطی زیر با کارشناسان ما تماس بگیرید.

√ سفارش آنلاین: ثبت آنلاین سفارش

√ سفارش با ایمیل: info@atrmed.com

√ تلفن: ۶۶۳۶۱۵۴۳ -۰۲۱ و ۶۶۳۷۹۰۲۶-۰۲۱

√ موبایل: تماس: ۰۹۱۰۸۶۲۵۸۲۴-۰۹۹۱۲۸۰۸۵۹۲_۰۹۹۱۲۸۰۸۵۹۱

√ آدرس: تهران، بزرگراه یادگار امام، خیابان امام خمینی، بین خ قصرالدشت و کارون، کوچه الله وردی، پلاک 13 واحد ۷

 

 

5/5 ( 1 نظر )

دیدگاه بگذارید

avatar
error: امکان کپی برداری از اطلاعات وجود ندارد!!